卵巢囊肿如果不是很大，一般选择腹腔镜手术，因为腹腔镜手术是比较成熟的，而且手术的创伤比较小，术后恢复也非常快。它的具体操作是：首先需要在肚脐以及肚脐两边打3个孔，大约是1-2cm，然后将腹部膨起，一般使用二氧化碳。
再将器械进入盆腔，观察卵巢囊肿的位置以及大小，观察周围有无粘连，进行一般处理之后将卵巢囊肿剥除就可以。如果卵巢囊肿比较大，首先将里面的液体抽吸之后再进行剥离。