先兆流产的原因很多，其中最为常见的原因就是胚胎和胎儿的染色体出现异常，数目异常较多见；另外一个常见的原因就是孕妇自身的内分泌功能异常，孕酮偏低，也会导致流产。
子宫畸形，子宫肌瘤，子宫颈口松弛，孕妇患有贫血、高血压、肝病、肾病、心脏病等全身性疾病，甲状腺功能减退，免疫功能异常，精子异常，过度紧张，外伤等都可能引起先兆流产。