卵巢巧克力囊肿就是由于子宫内膜异位到卵巢上，周期性的生长发育萎缩而引起。卵巢巧克力囊肿考虑可能是由于剖腹产手术、人工流产和宫腹腔镜操作引起。
卵巢巧克力囊肿会导致进行性加重的痛经，而且可能会出现不孕，在同房的时候，还会出现深部的性交痛。如果卵巢巧克力囊肿破裂，那会引起突发性的剧烈腹痛，而且还会伴有恶心，呕吐和肛门坠胀等表现。