卵巢早衰比较普遍的症状有月经紊乱，大部分表现为月经稀发、月经量少，少数会发生突然闭经，因为卵巢功能下降造成的不排卵，会引起病人的受孕率的下降以及不孕。
另外，由于雌激素水平下降会引起类似围绝经期的各种症状，远期的并发症包括骨质疏松、心血管疾病的发生率较同龄女性高，老年痴呆症发生的时间提前等。