对于龟头炎的病人到三甲医院就诊，可以挂号全科医学科、普通外科、泌尿外科、男科和皮肤科。每个科室侧重点也略有不同，对于普通的细菌感染而引起的龟头炎，挂哪个科都可以治疗。
对于普通的包皮过长或者包茎，或者伴有糖尿病等病人需要进行手术处理的，还是挂泌尿外科。而对于怀疑有特殊细菌感染，如淋球菌、支原体性感染而引起的龟头炎，则挂皮肤科。