相同点是乙肝和甲肝都属于病毒性肝炎，分别由乙型肝炎病毒和甲型肝炎病毒感染引起的。不同点是乙型肝炎病毒属于嗜肝DNA病毒科，主要经血液、体液等胃肠外途径传播，大部分病人呈慢性感染，少数病例可发展为肝硬化，肝衰竭或肝细胞癌。
甲型肝炎病毒属于微小RNA病毒科，主要经消化道途径传播，主要表现为急性肝炎，可出现疲乏、食欲减退、肝大及肝功能异常等症状，无症状感染也很常见。