花斑癣如果不及时治疗，会形成色素沉着，严重影响外表，降低花斑癣患者的生活质量，影响人际交往和个人心理健康。花斑癣的危害在于皮损活跃时，也可有痒感，且容易反复发作，不胜其烦。
花斑癣的危害在于传染性强。因为花斑癣是由真菌引起的，所以具有传染性，但传染性一般不大。花斑癣的危害还在于会引起其他并发症。
花斑癣菌还可累及泪囊，引起阻塞性泪囊炎;花斑癣严重者称痤疮样糠秕孢子菌性毛囊炎，有脓肿形成。