分泌性中耳炎的治疗原则是清除中耳积液，改善咽鼓管的通气和引流功能，治疗病因，包括非手术治疗，手术治疗和病因治疗。
非手术治疗包括适当的抗菌药物治疗，短期口服糖皮质激素治疗，减充血剂喷鼻或滴鼻以及伴有鼻塞症状的咽鼓管吹扫。手术治疗包括鼓室穿刺术，鼓室切开术和鼓膜导管插入术。
病因治疗包括腺样体切除术，扁桃体切除术，鼓室镜和乳突切除术，以及积极治疗鼻、窦或鼻咽疾病。