经直肠彩超就直肠腔内超声检查，一般不会疼痛，但有肛门坠胀不适。直肠内超声前要求排空大便，饮适当的水充盈膀胱，检查前先做指检，腔内探头套避孕套后用橡皮筋扎好，套外涂用超声耦合剂，缓缓进入直肠内检查。
经直肠彩超检查主要检查复杂性肛瘘瘘管的走向以及和括约肌关系，直肠占位与肠壁的关系、直肠癌术后随访、明确恶性肿瘤分期等。