鼻咽癌晚期除了出现鼻塞、抽吸性血涕、头痛、耳鸣、听力下降等，还因肿瘤侵入翼额窝、眼眶，出现眶内容外凸、张口困难、视力下降等，肿瘤侵入颅内，累及多个颅神经，如三叉神经、外展神经、舌咽神经、舌下神经等，引起三叉神经痛、患侧面部麻木、面瘫、复视、视力减退、失明等。
出现颈部淋巴结转移，导致颈部淋巴结肿大。晚期肿瘤可以转移至骨、肺、肝等脏器，出现恶液质，因多脏器器官衰竭死亡。