脑神经衰弱的治疗应用心理治疗、行为疗法、配合药物及物理治疗，可以获得较好的疗效。抗焦虑、抗抑郁药物可改善焦虑和抑郁，也可使肌肉放松，消除一些躯体不适感。
其他治疗包括体育锻炼，旅游疗养，调整不合理的学习、工作方式等也不失为一种摆脱烦恼处境、改善紧张状态、缓解精神压力的一些好方法。
支持性和解释性的心理治疗可帮助认识疾病的性质和消除继发焦虑。