梅毒潜伏期查不出来，因为潜伏期体内的还没有产生能被检测到的特异性抗体。梅毒血清学实验是临床中常用的诊断梅毒的方法，检测原理是梅毒螺旋体进入人体血液内导致免疫系统产生反应，释放特异性抗体，如检测出这种梅毒特异性抗体，就可以确诊。
而梅毒潜伏期或梅毒早期，梅毒螺旋体还没有进入血液或者刚进入血液产生免疫反应，做检查可呈现阴性反应性。所以如果之前有高危性行为的话，需进行多次复检，不能只通过一次阴性检查结果而排除梅毒感染。