男性感染的hpv的亚型不同，出现的症状也是不同的。如男性生殖系统感染低危型hpv病毒，在阴茎以及肛周等部位会长出菜花状或者鸡冠状的疣体，大小不等，不疼不痒。
治疗时可以采用手术切除法激光或冷冻疗法，但是身体抗病能力低时容易反复发作。而男性生殖系统感染高危型hpv病毒一般不会出现症状，但携带病毒的情况下同房会传染给对方。
长期携带这种病毒也可能引起肛门肛管癌或者阴茎癌，但几率很低。所以男性携带高危型hpv病毒要注意增强身体的抗病能力，定期复查，必要时配合干扰素治疗。