临床上盐酸环丙沙星主要的功效就是用于治疗大肠杆菌、肺炎克雷伯杆菌等引起的泌尿生殖道感染，革兰氏阴性杆菌所引起的肺部感染，以及志贺菌、沙门菌等引起的胃肠道感染等。
婴幼儿及18岁以下的青少年要慎用该药，肾功能不全的患者要注意减量，同时还有可能引起恶心、呕吐、腹痛、腹泻、精神烦躁、头痛、头晕以及心血管系统等不良反应，患者使用过程中要密切观察。