如果是中、重度脂肪肝，需要去除病因，必要时配合药物治疗的。例如高脂血症引起的脂肪肝，可以服用降脂药。如果是糖尿病、高血压引起的，可以服用降糖药，降血压药。
若出现肝功能异常，可以服用一些保肝药物，例如水飞蓟宾等。如果是轻度的脂肪肝，可以通过饮食控制以及适当的体育锻炼治疗，比如少吃油腻、动物内脏、油炸食物等。