通常肠胃炎治疗主要分为对症治疗、对症治疗和抗菌素治疗。患者可口服葡萄糖电解质液来补充丢失的体液，如持续呕吐或脱水，需静脉补充葡萄糖、盐水或其他电解质，多吃清淡的流质或半流质食物。
还可以给予对症治疗，如有恶心、呕吐可给予止吐剂，有腹痛可给予解痉药。如确诊为感染性腹泻，可以注射有针对性的抗生素，并配合使用调节肠道菌群的药物进行治疗。