临床上丝状疣的治疗要根据患者的病情来选择，部分患者在没有治疗的情况下也会自然的消退，不需要进行治疗，如果疣体影响到了外观，可以选择激光治疗和药物治疗。
在治疗疣体的时候主要是以破坏疣体、调节部分皮肤的生长、刺激局部或者是全身的免疫力为主要手段。经常采用的方法主要是物理治疗和外用药物进行治疗，其中系统药物治疗多被用于皮损数目比较多的患者，或者是久治不愈的患者。