加味逍遥丸具有舒肝清热，健脾养血的功效。加味逍遥丸方中加味牡丹皮、栀子，增加了清热、活血、通经的功效。临床适用于肝郁血虚，肝脾不和，两胁胀痛，头晕目眩，倦怠食少，月经不调，脐腹胀痛等症状，治疗效果显著。
加味逍遥也是妇科临床用药，主要是柴胡、当归、白芍、白术（麸炒）、茯苓、甘草、牡丹皮、栀子（姜炙）、薄荷。