霍香正气水具有理气中和、解表化湿的功效，外感风寒、内伤湿滞、湿热所致的感冒出现头疼、脘腹胀痛、胸膈痹痛、吐泻及肠胃型感冒等症状，均有较好的治疗效果。
人体出现手癣、头癣、足癣、灰指甲等局部真菌感染的表现症状时，可配合藿香正气水，进行局部外敷治疗。使用本品时，高血压及服用藿香正气水后应避免服用，应避免辛辣刺激性食物，以免发生意外。