龟头上长小肉疙瘩考虑是尖锐湿疣的可能性，也需要考虑跟龟头炎有一定关系。局部可以涂抹干扰素软膏来进行治疗。如果患者有过不洁性生活病史，并且小疙瘩呈现菜花状，逐渐增大，尖锐湿疣的可能性比较大，建议可以到医院做醋酸白试验明确诊断。
一旦确诊为是尖锐湿疣。建议可以做冷冻切除或者激光切除，切下来的组织拿去病理科进行化验分析，建议在医生指导下服用药物，对以上药物过敏者禁用，用药期间如有不适，及时就医。