陕西中医药大学第二附属医院是国家中医药管理局三级甲等中西医结合医院、全国重点中西医结合医院、陕西省中医药文化建设示范单位，中医住院医师规范化培训基地。医院由西咸新区新院、秦都老院和西安分院三部分组成。西咸新区新院是由陕西省中医药管理局和西咸新区管委全共建“西咸新区中心医院”，设置床位1500张；秦都老院（现医院）编制床位656张，实际开放床位859张，设临床和医技科室45个，职工1142人，其中高级职称200余人、硕博士150余人、临床教师近200名，年门诊量46万余人次，住院患者3.3万余人次，各类大型医疗设备260余台/件。　　医院现有国家临床重点学科和专科建设项目21个，其中国家临床重点专科（中医类别）1个，国家中医药管理局“十二五”重点专科3个、重点学科2个，陕西省中医药重点专科9个、重点学科2个，咸阳市重点专科4个。重点专科和学科分布在心血管病、脑病、糖尿病、血液病、肿瘤、脾胃病、肺病、妇产科、重症医学、治未病和中医康复学等重大疑难疾病和社会急需的专业，并开设国医堂和名老中医工作室5个，包括国医大师张学文教授等一批全国著名中医药专家长期座诊、查房和带教。妇产学科在陕西省医疗卫生系统中居于前列，2017年获批为“陕西省危重孕妇救治与转诊中心”，被誉为本地区“母婴健康的保护神”。近3年来，对口支援了7家本地区县级中医医院，与27家基层医疗卫生机构建立了对口合作关系，与4家基层医疗卫生机构签订了紧密型医联体（下派院长进行管理）。　　医院现设有陕西中医药大学心脑血管病研究所以及心血管病研究室、缺血性脑血管病研究室、中西医结合肿瘤研究室、中西医结合妇科病研究室、中西医结合肾病研究室、血液病临床研究室、妇科微创研究室、糖尿病及其并发症研究室等8个研究室；2014年，咸阳市批准了中西医结合防治心血管病证技术、中西医结合疾病复查与健康管理科技、血液系统重大疾病发病机制及诊疗技术、个体化用药及基因检测技术等4个市级科研创新团队。近5年来，医院承担各级科研项目200余项，获省部级科学技术奖6项，市厅级科学技术奖20余项，发表学术论文700余篇，其中SCI收录10余篇，申请批准国家专利20余件，出版专著和教材60余部。　　陕西中医药大学第二临床医学院是在整合陕西中医药大学第二附属医院和临床医学系医学一级学科建设资源的基础上，成立于2013年，现有教研室8个，临床教师196人；在校学生2000余名，研究生200余名。2014年-2016年连续三年在全国高等医学院校临床技能竞赛中荣获西北西南分区赛二等奖、特等奖，全国总决赛二等奖、一等奖。　　“十三五”期间，医院将围绕“一个中心、三个融合、一个新目标、两个新起点”的发展思路，秉承“为人民服务”的宗旨，坚持“突出特色，医教协同；人才强院，科技兴院”的发展战略，充分发挥公立医院公益性，新院、老院、分院三部分各具特色，共同发展：西咸新区新院占地300.96亩，拟于2019年投入使用，建成后开设床位1500张，定位于集医疗、教学、科研、健康管理与药物研发于一体的发展模式，突出中西医结合诊治重大疑难疾病的特色；秦都老院在整体搬迁后改造开设床位300张，设置能够适应社会养老与健康维护服务体系要求的中医特色专科（专病），定位于“医养结合”创新模式的发展模式，突出中医药养生康复的特色；西安分院开设床位50张，设置能够适应区域社区医疗服务的综合功能科室，定位以社区医疗为主发展，突出中西医结合慢病管理的特色。三院执行“统一垂直管理，业务分开核算”机制，在新形势的信息化条件下探索医疗和管理的流程再造，打造“智慧医疗”。力争在“十三五”期间，将医院建设成为集医疗、教学、科研、慢病防控和药物研发于一体的高水平大学附属医院和大型三级甲等中西医结合医院以及西咸新区中心医院，服务于国家“一带一路”战略，弘扬中医药文化，推广中医药技术，带动和推进陕西省乃至全国中医药事业的振兴发展。