肉芽肿性前列腺炎的治疗主要是需要服用抗菌消炎类的药物，中药治疗作为辅助。抗生素类的药物和消炎类的药物要交替应用，治疗及时肿块会迅速消失。
中药治疗为补肾阴、软坚、活血化瘀、清热解毒、化湿利水。胎盘组织液肌内注射也是有显著疗效的。少数有严重梗阻症状的患者需行前列腺切除。
绝大多数在几个月内症状缓解，硬结可消失，如不消失可能与病灶纤维化有关。