阴茎短小，可能是阴茎皮肤导致阴茎牵扯在内部，阴茎皮肤下的纤维导致阴茎受到牵连。也可能是尿道的关系导致阴茎的生长出现问题，腹壁或耻骨上的脂肪增多，导致阴茎凹陷在内部，使阴茎看上去显得比较短小。
如果是生理性阴茎短小，可通过手术治疗，去除多余的脂肪，使阴茎得以延长至正常长度。如果是病理性阴茎短小，染色体异常、克氏综合征、卡尔曼综合征导致的阴茎短小，应及时到当地医院就诊，明确病因，对症治疗。