扁平疣是因为病毒的感染引起的疾病，主要是通过直接接触传染,但是也可通过污染物，如针、刷子、毛巾等间接传染。另外，外伤也是引起传染的重要因素，平时经常可见到扁平疣沿着抓痕分布排列成条索状，这就是外伤引起传染的一个例子。
而且如果是在人体出现感冒，发热，精神创伤，过度劳累，月经期或内分泌失调等人体抵抗力降低情况下，体内潜伏的疣病毒则可骤然发病，出现较多疣疹的。