小孩扁桃体肥大应进行充分的抗感染治疗：抗病毒口服液或阿莫西林克拉维酸钾口服，彻底清除病原体。如果是慢性扁桃体肥大，小孩5岁以上，有睡眠打鼾、张口呼吸、夜间睡眠呼吸暂停；
或引起类风湿性关节炎、风湿热、心肌炎、肾炎；或扁桃体多次发炎，长期不能治愈；可以考虑手术切除扁桃体。扁桃体肥大通常是由反复刺激炎症引起的。
如果是扁桃体肥大引起的急性炎症期，无论是细菌感染还是病毒感染，都应进行充分的抗感染治疗。