强的松常见的副作用有类肾上腺皮质功能亢进，长期应用可出现向心性肥胖，满月脸，痤疮，多毛，乏力，低血钾，浮肿，高血压，糖尿病等症状，称为柯兴氏综合症。
肾上腺皮质机能减退症，长期应用强的松，抑制下丘脑垂体肾上腺素引起Acth分泌降低，导致肾上腺皮质废用性萎缩。诱发和加重感染，是由于机体防御机能降低，诱发感染或潜在性病灶扩散。
抑制生长发育，因此妊娠早期和后期均不宜使用强的松。长期应用强的松可以兴奋中枢而激动、失眠，儿童应用大剂量可引起惊厥、精神失常、癫痫发作，水钠潴留诱发高血压，血糖升高诱发糖尿病，血脂升高易发诱发动脉硬化等。