临床上神经病学和神经外科的区别在于治疗的主要疾病不同，治疗方法也不同。神经科主要治疗脑梗塞、脑出血、后循环缺血、头晕、头痛、癫痫、脑炎、周围神经病、面瘫、失眠、重症肌无力、多发性硬化、脊髓炎等。
治疗方法是药物治疗。神经外科也治疗脑梗塞和脑出血，大面积脑梗塞需要骨瓣减压或大面积脑出血需要开颅血肿清除术。