肛周湿疹主要通过药物进行治疗，主要分为口服药物和外用药物。患者可以服用氯雷他定、西替利嗪等抗组胺药进行治疗，可以起到止痒的作用。
如果肛周湿疹继发感染，患者可以服用头孢呋辛、左氧氟沙星等药物抗感染治疗。患者可以在患处涂抹他克莫司软膏、吡美莫司软膏等药物，对于治疗肛周湿疹也有一定疗效。
以上药物需要在医生指导下使用。如症状持续不能缓解，应及时就医诊治。