打完疫苗胳膊酸痛的原因如下：
1.可能是由于人体的免疫系统对疫苗起了免疫反应。是由免疫反应导致的炎性症状，从而导致局部的炎症细胞浸润、肌肉纤维组织破坏，从而造成肌肉的酸痛。
2.还可能是肌肉注射的时候，针头刺激到了手臂的末梢神经而导致的末梢神经炎或者末梢神经根水肿。 建议及时到医院进行相关检查并接受治疗，以免耽误病情，错过最佳治疗时机。