引起肾结石的原因有气候因素、饮食因素、药物因素、代谢异常、尿路因素等。夏季是结石的高发期，在夏季时，由于人体排汗会流失过多的水分，如果补充水量不足，可能会导致尿液浓缩形成结石。
而且在饮食方面，如果水分摄入不足，尿液浓缩，过量地吃动物的蛋白、肥腻以及钙、钠含量多的食物，体内缺乏维生素时，也会导致肾结石发生率增加。
除此之外，如果长期服用糖皮质激素类药物、维生素以及抗生素类药物，可能会导致身体代谢异常，继而让尿液中的钙、草酸、尿酸等物质浓度升高，进而诱发肾结石。