耳聋左慈丸的副作用是会出现过敏症状。但是如果患者患有高血压、糖尿病、肾病等疾病，服用耳聋左慈丸后，可能会加重病情，延长疾病的治疗时间。
在服用耳聋左慈丸时，若与其他的药物同时服用，则可能会影响药效或者对机体产生不利的影响。如果一定需要服用，必须在医生的指导下进行用药，脾虚便溏者慎用，感冒时不宜服用。