牙龈肉上有个洞眼如果是牙齿根尖炎，根尖区阴影面积较小，通常可以行根管治疗。如果牙齿根尖阴影面积较大，则可能形成根尖肉芽，需要使用手术手段刮除根尖肉芽以后再行根管治疗。
如果是根尖周脓肿，根管治疗把根管内所有的感染物质，比如坏死的牙髓、侵入的细菌、菌斑、微生物彻底清除干净，然后再用生物材料进行填充，避免感染物质长期对根尖部的刺激，使得机体根尖部产生自我修复能力。
还有根尖部外科手术治疗，如果根尖周破坏较多，已经有深部的病变，如周围的炎性组织，可能需要做根尖部外科手术治疗，进行根尖部的彻底刮治和清除，进行倒充填。
建议在医生指导下选择适合自己的方案治疗。