肛门有肉突出疼可能是内痔脱垂引起的，可以选择内痔注射疗法，常用苯酚植物油、鱼肝油酸钠等药物。也可能是痔疮引起的，可以外用麝香痔疮栓、痔疮宁栓等药物治疗。
还可能是混合疮合并血栓引起的，可以选择手术治疗，建议患者去医院查明病因，对症治疗。应遵医嘱服用药物，对以上药物过敏者禁用，用药期间如有不适，及时就医。