支原体、衣原体阳性，提示机体感染支原体、衣原体，可使用抗生素进行治疗。衣原体、衣原体感染可累及呼吸系统、泌尿系统、生殖系统等，在儿童群体中比较常见。
治疗上可使用大环内酯类，如阿奇霉素、克拉霉素、红霉素；氟喹诺酮类（18岁以下禁用），如左氧氟沙星、莫西沙星、环丙沙星；
四环素类（8岁以下儿童禁用），如四环素等予以治疗。如果成人对大环内酯类耐药，可以换成氟喹诺酮类。目前未发现支原体、衣原体对氟喹诺酮类耐药的现象，所以用左氧氟沙星、莫西沙星均可以有效，但要用足疗程。
注：以上药物的使用均在医生的指导下使用。如果支原体、衣原体阳性，建议及时前往医院在医生指导下，明确病因，在医生的指导下进行相应的治疗。