出现肛门疼痛的原因有很多，治疗方法如下：
1、精神因素(包括神经性):对神经因素引起的疼痛，要从心理上给予治疗，同时适当给予维生素及安定类药治疗。对神经因素引起的肛门痛如坐骨神经痛，要诊断导致坐骨神经痛的具体病因，解除病因，肛门痛就会消失。
2、肠道感染、便秘和腹泻：运用抗生素或通便药等进行对症治疗，如阿莫西林、阿奇霉素、乳果糖口服液、莫沙必利等，使肠道感染、便秘和腹泻病情得到控制或治愈。
3、肛门直肠周围感染或脓肿:及时切开引流或行根治术。
4、肛门疾病和肛门肿瘤:及时治愈痔、瘘、裂等肛门疾病，手术切除肛门肿瘤，肛门疼痛即可减轻。 出现肝门疼痛，要及时就医，找对病因，对症治疗。