甲状腺功能减退会引起的并发症有：甲减性心脏病、心包积液、心脏扩大、心搏出量减少，另外还能引起阻塞性睡眠呼吸暂停综合征、浆膜腔积液等。
还可以使记忆力减退、注意力下降。同时甲状腺功能减退还是心血管病的独立危险因素，可以引起血脂异常，增加心脑血管病的发病风险。
此外，甲状腺功能减退如果发生在妊娠期间，会增加流产、早产、死胎的风险且会对胎儿中枢神经系统发育造成不良影响。一旦确诊甲状腺功能减退一定要及时就医，坚持治疗。