细菌性脑膜炎和病毒性脑膜炎在临床症状上，有的时候比较难以区别，需要借助辅助检查的结果。比如病毒感染，白细胞总数不高，或者白细胞分类以淋巴细胞升高为主；细菌性感染，白细胞总数是升高的，分类以中性粒细胞升高为主。脑脊液的检查是主要的鉴别方法。病毒性脑炎脑脊液里面的细胞数比较少，蛋白定量偏低；细菌性脑炎脑脊液的白细胞数比较高，超过0.01×10^9个/L，这是主要的鉴别手段。