胚胎停育主要原因有四个方面，
一、生殖内分泌方面，胚胎早期发育需要三个激素水平，一个是雌激素，一个是孕激素，一个是绒毛膜促性腺激素，母体自身内源性激素不够，就会造成胚胎的停育。
二、生殖免疫的问题，母体有某种抗体抵制胚胎的发育。
三、子宫的问题，如果是子宫的内环境不好或者是畸形也不会发育，
四、染色体的问题。