男性生殖器疱疹的症状是局部长小水疱，簇集或散在分布，伴随着疼痛感，大约过2-4天会破溃和糜烂，形成浅溃疡，然后慢慢结痂，同时可伴随着腹股沟淋巴结肿痛、低烧、头痛、全身无力等症状。
男性生殖器疱疹与高危性行为有很大关系，如性伴侣换生殖器疱疹，同房时可导致皮肤粘膜破损，这些破损部位沾染生殖器疱疹病毒就可以引起症状。
感染生殖器疱疹病毒后并不会立即出现症状，大约经过3~14天的潜伏期，如果怀疑自己被感染，可进行细胞学检查、核酸检测、病毒培养。