如果检查发现HPV感染，还要分清是低危型还是高危型，然后根据感染的类型制定治疗方案。如感染高危型HPV，不必太紧张，平时要注意通过饮食和锻炼等方法提高身体抗病能力，也就是通过自身抵抗力将病毒清除。
同时应定期复诊，必要时遵照医嘱使用免疫增强药物促进病毒的清除。如果生殖系统查出了低危型HPV，外生殖器和阴道宫颈等部位会长尖锐湿疣，可根据疣体的大小选用药物或者手术、冷冻、电灼等方法治疗。