指甲盖疼痛的原因可能是甲沟炎、甲真菌病、外伤等导致的，可根据具体的病因予以治疗。
1.甲沟炎：指甲周围的软组织、甲皱襞的炎症，由于撕了指甲周围的角化皮肤，局部皮肤出现破损。从而导致局部发生甲沟炎，也可导致按压指甲盖时指甲盖疼。一般外用碘伏局部控制感染治疗；严重者可联用阿莫西林、氧氟沙星口服抗感染治疗。如有脓肿，可考虑手术切开引脓。
2.甲真菌病：是皮癣菌侵犯甲板或甲下所引起的疾病，通常叫做甲癣或者灰指甲。它可以引起指甲和甲周围的炎症，所以会导致疼痛。可外用阿莫罗芬、特比萘芬等灭杀或抑制真菌的生长；若外用药物效果不佳，还可口服伊曲康唑、酮康唑等药物联合抗菌治疗。若疼痛严重还可用利多卡因局部喷涂或服用布洛芬、对乙酰氨基酚等止疼治疗。
3.外伤：指甲受到外伤，如指甲上扎个刺也可导致指甲盖出现疼痛。对于外伤导致的指甲盖疼痛，需先祛除诱因，使用碘伏或酒精局部消毒，预防感染发生。疼痛严重者可局部使用利多卡因喷涂镇痛治疗。以上药物使用时谨遵医嘱，如果症状比较严重，建议患者尽早前往医院就诊治疗。